İstatistik Analizler - genexcellbiotech

Biyoinformatik Analizler

Yeni nesil dizileme (NGS) sistemleri, tek baz çözünürlüğünde ve yüksek kalitede milyonlarca okuma (reads) üretmektedir ve bunlar ham veriler olarak ifade edilmektedir. Bu nedenle yeni nesil dizileme sistemleri tarafından üretilen bu ham verinin analiz edilerek biyolojik olarak anlamlı bir hale getirilmesi gerekir. Bu noktada güvenilir ve kapsamlı biyoinformatik analizler çok büyük önem arz eder; aksi takdirde, yoğun emeklerin verildiği ve yüksek harcamaların yapıldığı bu tür çalışmalarda elde edilen ham veriler kullanılmayan/kullanılamayan bir bilgi yığını olarak kalacaktır.

GeneXCell Biotech deneyimli uzman kadrosuyla aşağıdaki biyoinformatik hizmetlerini sunmaktadır.

de novo assembly – referans genomu olmayan türlerde NGS okumaların (reads) birleştirilerek genomun ilk defa oluşturulmasıdır.
Haritalama (mapping) – NGS okumalarının (reads) referans genoma haritalanmasıdır.
Gen ve genom annotasyonu – gen ve ya genomun yapısal (intron, ekzon, intergenik vs) ve fonksiyonel (gen adı, görevi vs) olarak adlandırılmasıdır.
Yapısal analiz– DNA/RNA dizisinde, SNP, DIP, CNV, PAV, duplikasyon, inversiyon, genomik rearrangement’ların belirlenmesidir.
Sinteni/karşılaştırmalı genom analizi – farklı türlerin genomları arasında korunmuş homolog genlerin ve gen düzeninin analiz edilmesidir.
Gen paneli analizi – dizilenmiş belirli gen gruplarının yapısal ve fonksiyonel analizi ve akademik/klinik seviyede raporlanmasıdır.
RNAseq/transkriptom analizi – ifadesi olan tüm RNA türlerinin annote edilmesi ve ekspresyon değerlerinin belirlenmesidir.
mRNA analizi – ifadesi olan mRNA’nın annote edilmesi ve ekspresyon değerlerinin belirlenmesidir.
miRNA analizi – ifadesi olan miRNA’nın annote edilmesi ve ekspresyon değerlerinin belirlenmesidir.
miRNA hedef gen analizi – miRNA hedef ve ya hedeflerinin yapısal ve fonksiyonel analizidir.
lncRNA analiz – ifadesi olan lncRNA’nın annote edilmesi ve ekspresyon değerlerinin belirlenmesidir.
Genom çaplı analiz – Bir gen ailesinin tüm biyoinformatik analizlerini kapsamaktadır.

Biyoinformatik Analizler

Biyoinformatik Analizler

Adres

İletişim

Sosyal Medya